A Trama se passa depois do Arco “O Mistério do Stigmata [Livro 1003]”. Himeko Murata,acabou gravemente ferida em Chiyou ,e sua condição estava pior devido a infecção Honkai avançada em seu corpo. Em Choque por ser muito fraca e ser incapaz de proteger quem ela ama, Kiana participa de um rigoroso treinamento projetado pela Theresa para ficar mais forte. Mas ao mesmo tempo, a organização rival da Schicksal, a Anti-Entropy, começa a invadir a escola St.Freya!