O estudante Sho Fukamachi encontra um estranho objeto no campo que então une-se ao seu corpo para criar a armadura biológica Guyver, criada pelos extraterrestres que derem origem à vida humana na Terra. A Corporação Cronos, que visa conquistar o mundo, está atrás desta super-arma e envia seus Zoanoids, humanos transformados em monstros, para arrancar a Unidade Guyver de Sho. Em suas inúmeras batalhas, Sho e seus amigos, Testuro, Mizuke e Agito (Guyver III), encontram inimigos e aliados para sobreviverem e também salvar o mundo da ameaça da Cronos e seus 12 poderosos líderes Zoalords. A jornada de Fukamachi vai desde um tímido estudante até um confiante guerreiro forjado em vitórias e derrotas.