Depois que um ataque biológico terrorista matou algumas pessoas em uma cidade da Rússia, a Terceira Unidade Especial de Segurança Pública, de codenome Terceira-I, acredita que a organização terrorista responsável pelos planos é a mesma que utilizou o vírus Bloody-X em Tóquio. Subsequentemente, a Terceira-I requisita a ajuda do hacker gênio, Takagi Fujimaru, para descobrir o que aconteceu na Rússia. Entretanto, com o envolvimento de Fujimaru, ele logo descobre que é visado pelos terroristas que possuem influência não só em seu colégio, como também na própria polícia! Fujimaru deve confiar em suas habilidades com hacker para solucionar o sinistro esquema desta organização e descobrir a verdade por trás de “Bloody Monday”.