Kudo Shinichi, de 16 anos, é um famoso Detective da Escola Secundária. Certo dia, Kudo convida Mouri Ran para irem a um parque cujo nome é Tropical Land. Depois de resolver um caso que ocorreu nesse dia, Kudo apercebe-se de 2 pessoas vestidas com trajes pretos e segue-os. Enquanto vigiava-os, Kudo é alvo de uma pancada na cabeça por um outro homem de negro. Após o porem inconsciente, os homens de negro dão-lhe uma droga que supostamente o mataria porém isso não acontece e Kudo volta ao seu corpo de 8 anos. Intitulando-se de Edogawa Conan, Kudo vai morar para a casa da Ran, com a intenção de ficar mais perto de outros casos e assim ter a hipótese de apanhar os homens de negro, pois o pai de Ran é um famoso detective.